Introduksjon til R (English)
R er en omfattende og fleksibel programvare for dataanalyse og
-visualisering. R er "open source" og gratis tilgjengelig fra nettet
og fra programvarebibioteket ved NTNU.
Tilleggspakker ("packages") finnes for de fleste fagområder som f.eks.
forsøksplanlegging, epidemiologi og farmakokinetikk. R er i utgangspunktet er kommandostyrt og har nok en viss
brukerterskel sammenliknet med "regneark"-baserte alternativer som
SPSS. Som tillegg til kursene i medisinsk statistikk vil vi
demonstrere R for interesserte.
Foreleser: Eirik Skogvoll, professor / overlege ved Klinikk for Anestesi og
akuttmedisin, St. Olavs Hospital.
Forberedelse
Alle bør (må) ha installert R på egen laptop, lastes ned (gratis) fra www.r-project.org. R er også tilgjengelig på DMF sin terminalserver og -programvarebibliotek.
Vi vil følge Owen: The R Guide underveis, med unntak av 2.3 om matriseoperasjoner og 6.2 om Monte Carlo simulering. Aktuelle kommandoer gjengis som tekstfil her. Det er lurt å ha tilgang til filene passengers.txt og Ros.t.11.1.dat på egen maskin.
Øvrig litteratur:
An Introduction to R (finnes også på hjelpmenyen i R)
R Refcard
Peter Dalgaard.
Introductory Statistics with R.
Springer, 2nd edition, 2008.
ISBN 978-0-387-79053-4.
Everitt, B. S. and T. Hothorn. A Handbook of Statistical Analyses Using R. Chapman & Hall/CRC, 2nd edition 2010 ISBN 978-1-4200-79333-3
Introduction to R
R is a comprehensive and flexible software for data analysis and
visualisation, closely related to the commercial product S-Plus. R is
open source, continuously developing, and freely available from the
Internet. Add-on packages exist for most special tasks and subjects
like experimental design, epidemiology and pharmacokinetics. Being
mainly command driven, R may be less intuitive for unexperienced
users compared to spreadsheet-like alternatives.
As a companion to the courses in medical statistics, we give a short presentation of R.
Lecturer: Eirik Skogvoll, Professor and
Consultant, Dept. of Anaesthesiology and Emergency Medicine,
St. Olav University Hospital
Preparation for the lecture
You should have R installed on your own laptop. The program may be downloaded (for free) from www.r-project.org. R is also available at the Faculty of Medicine from the Software Portal ("Programvarebiblioteket") and the terminal server.
We will follow Owen: The R Guide
during the lecture, except 2.3 about matrix operations and 6.2 on Monte
Carlo simulation. The relevant commands are given as a text file here. It is also a good idea also to be able to access the following files on your own laptop: passengers.txt and Ros.t.11.1.dat.
Further literature:
An Introduction to R (also available from the Help menu in R)
R Refcard
Peter Dalgaard.
Introductory Statistics with R.
Springer, 2nd edition, 2008.
ISBN 978-0-387-79053-4.
Everitt, B. S. and T. Hothorn. A Handbook of Statistical Analyses Using R. Chapman & Hall/CRC, 2nd edition 2010 ISBN 978-1-4200-79333-3